Der Unterschied zwischen EMAS und ISO 14001 liegt im rechtlichen Rahmen, im Anwendungsbereich und in den formalen Anforderungen. ISO 14001 ist ein international anerkannter Standard für Umweltmanagementsysteme und wird durch eine Zertifizierungsstelle zertifiziert. EMAS ist ein von der Europäischen Union geregeltes Umweltmanagement- und Auditsystem. Im Rahmen von EMAS ist zusätzlich eine validierte Umwelterklärung erforderlich, die öffentlich zugänglich gemacht wird. Zudem setzt EMAS eine offizielle Registrierung bei einer zuständigen Stelle voraus, was über die Anforderungen der ISO 14001 hinausgeht.