Genel olarak yılda en az bir adet iç HACCP denetimi yapılmalıdır. HACCP belgelendirmesinde başlangıçta bir belgelendirme denetimi gerçekleştirilir. Belgenin geçerliliği süresince genellikle her yıl bir gözetim denetimi uygulanır. Sertifika süresi sonunda yeniden belgelendirme denetimi yapılır. Önemli değişiklikler olması halinde ilave denetimler gerekebilir.