HACCP kontrol listesi, HACCP sisteminin temel ilkelerinin standartlara uygun şekilde uygulanıp uygulanmadığını değerlendirmek amacıyla kullanılır. Bu kapsamda tehlike analizi ve kritik kontrol noktalarının belirlenmesi incelenir. Kritik limitlerin tanımlanması ve izlenmesi de kontrol edilen hususlar arasındadır. Ayrıca düzeltici faaliyetler, doğrulama süreçleri ve kayıtların yönetimi değerlendirilir. Bu kontroller, belgelendirme kapsamında uygunluğun tespit edilmesine temel oluşturur.